战中，满桂多次受到天启帝的封赏，其他的将领却封赏不足，于是开
始羡慕嫉妒记恨疏远满桂，认为宁远大捷不是满桂一个人的，为何朝廷只重赏他一个人呢？
宁远大捷之前，满桂和赵率教的关系非常不错，常有往来、英雄相惜。但是宁远之战的时候，赵率教以各种理由为搪塞没有亲自率兵前来援救宁远。如果不是满桂和袁崇焕死守住了宁远，宁远早就被后金攻下了。于是满桂从此很记恨赵率教在万难之中没有来救援自己、满桂和赵率教开始因为这件事情互相指责起来。
将领之间的不和越来越发展严重，袁崇焕也开始和满桂不和起来，还向朝廷上疏请朝廷把满桂抽调到别的兵镇，以免影响辽东的大局。朝廷无法调和以后，只得把满桂于同年闰六月以原职在中军府办理佥书的事务，而关外的事权都交给了赵率教。此事最后各方拉拉扯扯不好收场，当时的督师王之臣也调解不了。
朝廷把满桂调离关外以后，袁崇焕在关外独自难以支撑局势，寸步难行，同时也想着以大明的大局为重，于是又向朝廷上疏请求调满桂回来镇守山海关。正合天启帝的意思，于是朝廷命令满桂挂印移镇山海关，同时天启帝还任命满桂兼任统领关外四路及燕河、建昌等地的驻军，接着又赐下尚方宝剑给满桂，大明皇帝的对满桂的这份敬爱一直延续到崇祯二年满桂英勇战死的那一刻
时间到了天启七年，也就是天启帝生命的最后一年，后金不甘心去年的失败，于五月再次出兵十万余同时进攻锦州和宁远。身在山海关的满桂知道了以后，立即亲率手下的明军前去救援，在宁远城外与后金军展开血战，击穿了后金包围宁远的重围而进入了宁远城中。这个时候，城中的袁崇焕终于对满桂的大仁大义敬佩万分，两人捐弃前嫌、大义释然、开怀大笑起来，共同商议如何抵御凶猛的后金军。满桂部进入宁远不久，后金大军支援过来重新包围了宁远城，满桂和袁崇焕商议，自己率兵出城迎战后金军，让袁崇焕死守宁远城。接着，满桂亲率副将尤世威和明军出城硬抗后金的八旗兵，血战数个时辰，袁崇焕在城上用大炮配合，满桂身负重伤终于击退后金大军，等后金大军一退，满桂自己也倒在了战场的血泊中，袁崇焕流泪满面的赶出城来把满桂接入城中医治。
朝廷知道宁锦大捷的消息以后，大加赞赏满桂的忠义，加封满桂为太子太师，世荫锦衣佥事。袁崇焕被弹劾以后，接任的督师王之臣十分推崇满桂，上疏请朝廷再次派满桂镇守宁远，以挡后金凶猛的八旗兵。这时，蒙古的许多部落发生分崩离析和内乱不止，满桂和督师王之臣趁机收纳了十几万蒙古人归顺明军，从中又挑选出数万精锐效命朝廷，朝廷再次赞扬满桂的卓越功勋，此年满桂三十三岁。
还是在天启七年，重病在身可怜兮兮的天启帝于八月终于没有挺过去而驾崩了，信王朱由检在各方角逐的因素下即帝位，接下了大明朝这个烂摊子。
天启帝驾崩的天启七年和崇祯元年这一年多的时间里，发生了严重影响辽东局势的事情。刚刚即帝位的崇祯帝只是一个懵懵懂懂的孩子，在大臣们的怂恿下也开始向各方手握重兵的将领显示皇威起来。崇祯帝下诏告诫辽东督师王之臣不要再蹈袁应泰和王化贞的覆辙，还连带批评满桂一意迎合自己的上司王之臣的主意不好。满桂颤抖着接下这份圣旨以后，心中不平有苦难言，于是上疏朝廷想要告病解职还乡宣府老家，从此不再带兵。朝廷和崇祯帝知道了以后，没有批准满桂的请求，因为朝廷只想在手握重兵的封疆大吏面前耍耍皇威，辽东甚至全国各地的大局，还是要靠这些能征惯战知兵懂兵的人才去镇守的。
崇祯元年七月，辽东督师王之臣陷入朝廷的内斗被弹劾罢官，牵连到了满桂，因此满桂也被朝廷解职并召回了军府候命。这个时候发生了一件影响满桂命运的事情，大同总兵渠家桢和巡抚张翼明因为插部西侵，蒙古顺义王进入大同大肆掠夺而被朝廷制了死罪。于是朝廷就命令在军府待命的满桂接替他成为了大同总兵。大同重镇本来就与满桂的老家宣府重镇接近，也算满桂的半个老家，满桂高兴的接任成为了大同总兵，满桂在崇祯朝再次得到重用。满桂到任以后，发现大同长期以来仗着朝廷和蒙古议和而怠慢防守，于是才被顺义王轻易西侵成功。朝廷被逼无赖给予插部大量抚赏，插部得到抚赏以后更加的小瞧明朝而不愿意离开大同境内。朝廷这次任命满桂为大同总兵，也有让满桂治理大同和击退蒙古插部的意思和命令在里面。
满桂到任大同以后，一经了解大同的状况，知道大同总兵并不是一个好差事而是烫手山芋。满桂面临着整顿大同边防战备和击败插部的重任，于是满桂什么事情都亲力亲为，包括大同境内自己管辖范围内的八路七十二座城堡，每一座城堡满桂都亲自去视察和整顿吏治。从崇祯元年七月接任为大同总兵以后，满桂只准备了四个多月，于十一月至十二月在大同境内亲率大同兵将击败插部的顺义王，插部死伤数万兵力，之后插部退出大同境内，狼狈逃回了北方大草原。
满桂到任大同出任总兵以后，刚好一年零三个月